Екип от специалисти е създал програма, която позволява да се идентифицират и сравняват геномни области на животни. Благодарение на тази разработка ще бъде възможно да се проследи близостта на един животински вид до други в общата структура на йерархията и да се анализират промените, настъпили в представителите на различните видове в хода на еволюцията.
Милиони различни видове обитават планетата Земя. Ключови фактори като външен вид, начин на живот и хранителни навици се определят до голяма степен от генетичния набор. В същото време променливостта на тези набори значително се различава от броя на видовете, като експертите преброяват около 20 000 комбинации от различни гени. Така се оказва, че видовете се различават помежду си не само и не толкова по самите гени, а и по параметрите на тяхното разположение един спрямо друг. В науката има специален термин „синтетика“, който се отнася до специфична последователност от отделни елементи в генома.
Един от разработчиците на проекта, инженер Ксения Крашенинникова, дава пример с горила и шимпанзе, които имат идентичен набор от гени, но се различават един от друг именно поради различната им последователност.
За да открият точно какви са разликите между структурите на генома, експертите трябва първо да намерят тези несходни области. Невъзможно е да се направи ръчно, защото има твърде много данни, които трябва да се обработят. Ето защо учените се опитват да създадат специални програми, които улесняват и оптимизират процеса на подбор.
Новата разработка, наречена halSynteny, както уверяват разработчиците, се характеризира с по-висока скорост на обработка на данните в сравнение с предишните системи. Освен това софтуерът може да работи в два формата едновременно.
За увеличаването на скоростта на търсене на синтетични последователности допринася коренно различен подход. Обикновено техниките използват предварително анотиране, но в случая на halSynteny те включват техника за подравняване, при която различни области от един набор от гени се съпоставят с друг. В резултат на това се открояват сходни последователности и въз основа на тях се правят заключения за разликите.
Благодарение на използването на езика за програмиране C++ програмата е с подобрена производителност, така че всички изчисления се извършват няколко пъти по-бързо, отколкото с други методи.
Как точно ще улесни новата система работата на генните инженери и какви са предимствата, които ще им донесе?
Новата система ще улесни работата на генните инженери, като им предостави по-бърз и по-ефективен начин за манипулиране на геномите. Те ще могат по-лесно да редактират, изтриват и добавят гени, което ще ускори процеса на изследване и разработване на нови лекарства, борещи се с различни заболявания. Предимствата включват по-голяма прецизност и точност при извършване на генетични манипулации, по-бързо излекуване на болести, създаване на по-устойчиви и продуктивни растения и животни, както и развитие на персонализирана медицина, която да отговаря по-добре на индивидуалните нужди на пациентите.